Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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