Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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VAMP3Q15836 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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VAMP3Q15836 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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VAMP3Q15836 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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VAMP3Q15836 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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VAMP3Q15836 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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VAMP3Q15836 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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