Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP13Q15645 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIP13Q15645 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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