Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF1AQ15573 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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