Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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