Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3GAP1Q15042 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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