Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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