Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRCAPQ14761 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCAPQ14761 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms