Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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