Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCINQ13939 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCINQ13939 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCINQ13939 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCINQ13939 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCINQ13939 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCINQ13939 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCINQ13939 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCINQ13939 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCINQ13939 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCINQ13939 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCINQ13939 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCINQ13939 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCINQ13939 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCINQ13939 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCINQ13939 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
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