Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2H3Q13889 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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GTF2H3Q13889 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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