Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms