Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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