Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLAMF1Q13291 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms