Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLN3Q13286 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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