Protein–RNA interactions for Protein: Q13183

SLC13A2, Solute carrier family 13 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A2Q13183 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC13A2Q13183 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms