Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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