Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 CNOT2-212ENST00000548599 643 ntTSL 57.84□□□□□ -1.154e-10■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 CNOT2-224ENST00000550194 747 ntTSL 57.38□□□□□ -1.234e-10■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 CNOT2-234ENST00000551873 677 ntTSL 57.38□□□□□ -1.234e-10■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.341e-7■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.581e-7■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 SGMS1-208ENST00000608287 542 ntTSL 419.86■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 21.3
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TARDBPQ13148 AMPD2-212ENST00000486282 582 ntTSL 417.51■□□□□ 0.393e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 AMPD2-216ENST00000527846 585 ntTSL 417.4■□□□□ 0.383e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 AMPD2-223ENST00000531734 572 ntTSL 415.79■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 AMPD2-217ENST00000528270 588 ntTSL 415.69■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 AMPD2-209ENST00000474459 814 ntTSL 415.5■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 21.3
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TARDBPQ13148 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.163e-6■■■■□ 21.3
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TARDBPQ13148 AMPD2-201ENST00000256578 3899 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 21.3
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TARDBPQ13148 CRLS1-206ENST00000489345 644 ntTSL 54.86□□□□□ -1.633e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.673e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.518e-7■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.728e-7■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.238e-7■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.563e-10■■■■□ 21.3
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TARDBPQ13148 NSDHL-202ENST00000432467 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.36■□□□□ 0.213e-10■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.331e-8■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 BMS1P4-203ENST00000580790 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.91e-8■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 AC022400.3-201ENST00000399449 3810 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.111e-8■■■■□ 21.3
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TARDBPQ13148 PILRB-204ENST00000438028 1822 ntTSL 1 (best)18.58■□□□□ 0.577e-7■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 PILRB-206ENST00000443526 1364 ntTSL 1 (best)17.54■□□□□ 0.47e-7■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 PILRB-202ENST00000422808 1599 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.367e-7■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 PILRB-210ENST00000457519 2074 ntTSL 1 (best)17.02■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 PILRB-201ENST00000419749 1506 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.267e-7■■■■□ 21.3
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TARDBPQ13148 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-201ENST00000310771 3634 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.717e-7■■■■□ 21.3
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TARDBPQ13148 DHX37-206ENST00000544745 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.74e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 RPS6KB2-209ENST00000528964 1806 ntTSL 518.7■□□□□ 0.582e-9■■■■□ 21.2
TARDBPQ13148 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.512e-9■■■■□ 21.2
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TARDBPQ13148 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.341e-6■■■■□ 21.2
TARDBPQ13148 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.421e-6■■■■□ 21.2
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TARDBPQ13148 CDK5RAP2-209ENST00000473282 5956 ntTSL 1 (best)7.79□□□□□ -1.165e-8■■■■□ 21.2
TARDBPQ13148 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.747e-7■■■■□ 21.2
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TARDBPQ13148 ETFB-205ENST00000596253 575 ntTSL 314.78□□□□□ -0.047e-7■■■■□ 21.2
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TARDBPQ13148 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 21.2
TARDBPQ13148 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 21.2
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TARDBPQ13148 TXNDC11-204ENST00000571882 581 ntTSL 511□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 21.2
TARDBPQ13148 TXNDC11-209ENST00000576969 863 ntTSL 38.16□□□□□ -1.12e-6■■■■□ 21.2
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TARDBPQ13148 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.442e-8■■■■□ 21.2
TARDBPQ13148 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 21.2
TARDBPQ13148 ZNF609-203ENST00000558680 418 ntTSL 38.35□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 21.2
TARDBPQ13148 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.455e-7■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.355e-7■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.435e-7■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 PARK7-208ENST00000493373 624 ntTSL 512.35□□□□□ -0.435e-7■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 PARK7-202ENST00000377488 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.585e-7■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 PARK7-209ENST00000493678 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.715e-7■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 PARK7-207ENST00000469225 711 ntTSL 39.39□□□□□ -0.915e-7■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.367e-10■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.572e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 TPCN1-222ENST00000552897 596 ntTSL 423.8■■□□□ 1.42e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 TPCN1-216ENST00000551096 530 ntTSL 420.88■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 TPCN1-217ENST00000551099 570 ntTSL 420.54■□□□□ 0.882e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 TPCN1-212ENST00000549279 544 ntTSL 420.03■□□□□ 0.82e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 TPCN1-219ENST00000552077 3293 ntTSL 215.43■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 21.1
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