Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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