Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
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