Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms