Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms