Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms