Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN1BQ07699 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms