Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBQ06643 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LTBQ06643 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LTBQ06643 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LTBQ06643 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LTBQ06643 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LTBQ06643 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LTBQ06643 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LTBQ06643 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBQ06643 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBQ06643 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms