Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms