Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms