Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSG1Q02413 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms