Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms