Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms