Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms