Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms