Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms