Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFAMQ00059 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms