Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL13RA1P78552 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms