Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELF3P78545 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELF3P78545 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELF3P78545 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELF3P78545 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELF3P78545 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELF3P78545 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELF3P78545 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELF3P78545 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELF3P78545 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELF3P78545 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELF3P78545 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELF3P78545 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELF3P78545 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ELF3P78545 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ELF3P78545 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ELF3P78545 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ELF3P78545 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ELF3P78545 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ELF3P78545 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms