Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX6P78412 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX6P78412 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRX6P78412 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRX6P78412 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRX6P78412 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX6P78412 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms