Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHC1P78364 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHC1P78364 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHC1P78364 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHC1P78364 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHC1P78364 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHC1P78364 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHC1P78364 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHC1P78364 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHC1P78364 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHC1P78364 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHC1P78364 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHC1P78364 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHC1P78364 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms