Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms