Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms