Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERV-K104P61576 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms