Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms