Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00313P59037 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms