Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3BP58499 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3BP58499 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3BP58499 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3BP58499 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3BP58499 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM3BP58499 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM3BP58499 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3BP58499 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3BP58499 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms