Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP107P57740 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP107P57740 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP107P57740 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP107P57740 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP107P57740 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP107P57740 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP107P57740 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP107P57740 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP107P57740 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP107P57740 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP107P57740 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP107P57740 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP107P57740 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP107P57740 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP107P57740 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP107P57740 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP107P57740 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP107P57740 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP107P57740 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP107P57740 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP107P57740 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP107P57740 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms