Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms