Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN8P56748 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms