Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52P55327 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPD52P55327 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPD52P55327 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPD52P55327 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPD52P55327 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPD52P55327 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPD52P55327 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPD52P55327 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPD52P55327 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPD52P55327 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPD52P55327 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPD52P55327 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPD52P55327 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPD52P55327 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPD52P55327 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPD52P55327 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TPD52P55327 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPD52P55327 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPD52P55327 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPD52P55327 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TPD52P55327 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPD52P55327 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPD52P55327 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPD52P55327 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPD52P55327 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPD52P55327 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPD52P55327 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms