Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms