Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDST1P52848 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDST1P52848 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDST1P52848 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDST1P52848 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDST1P52848 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDST1P52848 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDST1P52848 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDST1P52848 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDST1P52848 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDST1P52848 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDST1P52848 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDST1P52848 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms